Tudo bem. W32Time (Horário do Windows) é agora um serviço de "início de gatilho", onde antes em versões anteriores do Windows era usado 24x7.
Você não deve ter problemas em confiar no serviço de integração de tempo de máquina virtual.
Ou, se o Azure não utilizar o serviço de integração de tempos de IC da VM, você poderá obter este documento como evidência de como seria esperado que sua VM do Azure sincronizasse seu tempo, caso não fosse configurado para fazer o contrário:
Termos de licença do Windows Azure.doc:
• Windows Time Service. This service synchronizes with time.windows.com once a week to provide your computer with the correct time. You can turn this feature off or choose your preferred time source within the Date and Time Control Panel applet. The connection uses standard NTP protocol.
Mas se você ainda quiser configurar seu próprio NTP personalizado, você é totalmente livre para fazê-lo se desejar. Basta definir o serviço de Tempo do Windows como Automático e, em seguida, emitir um comando como:
w32tm /config /manualpeerlist:"0.us.pool.ntp.org 1.us.pool.ntp.org" /syncfromflags:manual /update