O aplicativo precisaria ser configurado para usar uma das interfaces / IPs disponíveis no sistema. Se o aplicativo não tiver essa capacidade, ele usará a interface que vier primeiro na ordem de ligação do NIC em todo o sistema.
Se você não puder alterar a ordem de vinculação de NIC do sistema, considere uma solução de virtualização. Crie uma VM e um comutador virtual e conecte esse comutador virtual a qualquer NIC física desejada. Em seguida, conecte a VM que está executando seu aplicativo nesse vSwitch.