A) Clamav é atualizado o tempo todo e regularmente.
B) Que tipo de servidor é esse? Você pode não querer um antivírus tanto quanto se concentrar no IDS e na auditoria.
Se você está indo apenas para obter um AV no servidor, o ClamAV é provavelmente sua melhor aposta. Muitos usuários. Arquitetura conectável. Atualizado com mais frequência do que muitos comerciais, parece. Você pode configurá-lo para pesquisar regularmente por versões atualizadas. E é feito para sistemas * nix.
Apenas não confie nele como sendo sua melhor defesa, porque a menos que este seja um servidor de arquivos, AV (ou AV sozinho) simplesmente não o corta.