Entre os 2, alcatrão seria o vencedor no meu livro por causa da portabilidade que robertpostill menciona. Se eu fizesse algo assim sozinho, usaria o rsync.
Você mencionou que o desempenho não é um problema. Eu não sei qual velocidade de conexão você tem entre os dois sites, mas se você está fazendo um backup remoto e assumindo um up-speed de modem a cabo de 512KBps, você está olhando para quase um mês para transferir o 1TB completo. É por isso que eu pegaria uma cópia local primeiro (via rsync) e depois movo seu disco para o host remoto. Os rsyncs subsequentes copiarão apenas os arquivos que foram alterados.