Gosto de executar o hardware antigo o maior tempo possível, mas substituo a máquina. Você vai ter dificuldade em fazer qualquer progresso na resolução deste problema.
Minha suspeita seria interação sutil entre o firmware nas unidades "com falha", possivelmente o backplane hot-swap e o controlador RAID. Ninguém na Dell ou na Fujitsu está testando essas unidades mais do que esse controlador, e é improvável que alguém esteja interessado em qualquer uma das empresas.
Você está colocando a matriz em risco toda vez que isso acontece, já que a matriz está se degradando e sendo reconstruída. Se uma falha legítima ocorrer em outro disco durante o processo de reconstrução, você estará em um cenário de falha de matriz. Espero que você tenha bons backups.
É frustrante, porque a adição de discos deve funcionar bem, mas com algo dessa idade, você é realmente melhor do que morder a bala e conseguir algo com suporte ativo do fabricante.