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Atualização do Fedora 11, se isso for possível. Vale a pena.
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Se você não pode atualizar o sistema operacional por algum motivo, configure o PHP sem qualquer suporte a mysql, gd, etc. e veja se consegue fazê-lo funcionar. Teste com simples ou scritps.
Se isso funcionar. então atualize o mysql e tente somente com --with-mysql não adicione outras bibliotecas ao mesmo tempo. Se isso funciona. Em seguida, atualize o zlib e adicione o sinalizador zlib. Se alguma atualização como o mysql não estiver funcionando, atualize outras coisas e cuide do mysql mais tarde. Vai demorar mais de um dia para fazer as coisas funcionarem. Espero que valha a pena.
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Porta de encaminhamento de porta 80 deste servidor para a porta 80 do servidor com o SO mais recente, se isso for aceitável.