Também enfrentei essa exceção ao tentar implementar o OpenCMS e o OpenEJB na mesma instância do Tomcat. Parece que o OpenCMS e o OpenEJB não gostam um do outro.
No entanto, encontrei uma solução alternativa: depois de implantar o OpenCMS na inicialização do Tomcat, usei o aplicativo da Web do Gerenciador para fazer upload e obter o OpenEJB em execução. Funcionou bem para mim.