A diretiva ssl_certificate_key especifica sua chave privada (esse é o seu arquivo priv.key ).
A diretiva ssl_certificate especifica um arquivo contendo uma concatenação de seu certificado assinado (que você chama de cert.pem ), a Autoridade de Certificação e zero ou mais arquivos em cadeia.
A solicitação de assinatura de certificado não é usada por nginx .
É necessário ter cuidado ao concatenar os arquivos de certificado. Seu certificado deve ser o primeiro. Além disso, há muito lixo extra nesses arquivos em cadeia e não sei se é ignorado. Você pode querer editar o lixo.
Veja este documento para saber mais.