Seu próprio certificado é assinado por exatamente um certificado.
Isso significa que seu certificado está em uma extremidade de exatamente uma dessas cadeias Thawte, você precisaria de um certificado diferente para estar na outra cadeia (uma assinada pelo certificado intermediário dessa cadeia).
Quanto à assinatura do certificado raiz sendo SHA-1, SHA-2 ou outra coisa, é de pouca importância em comparação com outros certificados na cadeia, já que a parte validadora já possui os certificados raiz que eles confiam, eles não precisam de uma assinatura para verificar as raízes. (Veja, por exemplo, Reprovação SHA1: o que você precisa Conheça .
Examinando os certificados no Thawte SSL123 SHA- 2 (sob a raiz SHA1) verifica-se que um dos certificados intermediários ("Primary Intermediate CA") também é SHA-1 (não apenas a raiz). É quase seguramente este certificado para o qual você está "apagando". Você precisará fazer com que Thawte lhe envie um novo certificado assinado pelo certificado intermediário da outra cadeia para resolver isso.