- error.log do seu servidor httpd
- Seu php-error-log (onde quer que você o tenha configurado)
Além disso, isso não é suficiente para proteger seu sistema. Usar o IPS (como o SELinux) e um HIDS (como ajudante, samhain ou tripwire) ajudará mais do que isso.
Se o seu aplicativo PHP tiver problemas de injeção de SQL, será necessário revisar seu código, pois essas medidas também não ajudarão.