Esse log explica porque o MySQL morreu. Foi morto pelo assassino da OOM. O assassino da OOM é uma parte divertida do Linux que existe porque o Linux promete RAM aos processos e, quando eles realmente querem a RAM que eles prometeram, mata um deles para dar aos outros a RAM que eles querem.
Ele escolhe qual deles matar baseado em um algoritmo que parece classificar o MySQL muito bem. Provavelmente porque usa muita memória RAM.
Eu sugeriria executar o mysqltuner.pl (Get it with wget mysqltuner.pl
) na sua caixa do MySQL e também a saída de top
para ver quais processos estão usando toda a sua memória.