A melhor maneira de determinar o que você precisa fazer backup é percorrer um cenário em que o disco rígido do seu servidor não está mais inicializando.
Quais dados você necessitaria para colocá-lo on-line o mais rápido possível?
Este é um modelo básico (adaptado para * BSD) que eu uso:
Arquivos:
/etc/ssh
/var/log
/var/cron
/etc/ipfw.rules (ip tables in your case)
/etc/syslog.conf
/etc/motd
/etc/ssh/banner
/etc/shells
/etc/profile
/etc/login.conf
/etc/group
/etc/hosts
/etc/passwd
/etc/sysctl.conf
/etc/resolv.conf
/etc/rc.conf
/etc/rc.local
/etc/crontab
/etc/master.passw
Dirs:
/var/cron
Se você estiver executando outros serviços; você deve fazer backup dessas configurações também.