Parece que você tem um sistema de arquivos corrompido. Possivelmente causado por um disco rígido com falha. Execute o comando 'dmesg' e veja o que a saída diz. Se a sua unidade estiver falhando, você provavelmente verá muitos erros relacionados ao disco. Nesse caso, é hora de fazer um backup imediato de seus dados e comprar um novo disco rígido.