Eu prefiro o nginx over lighttpd pelas seguintes razões:
- Formato de configuração mais fácil e mais sensato.
- Mais e melhores módulos documentados
- É ativamente mantido e desenvolvido. Último lançamento importante foi há 2 anos.
Apenas os profissionais do lighttpd over nginx
1. Conversando com backends via HTTP / 1.1
2. Desova automática dos back-ends do FastCGI