O conteúdo do arquivo é o mesmo, então o rsyinc está enviando poucos dados. Mas suspeito que alguns dos metadados nos arquivos sejam diferentes. Eu estou supondo a criação versus timestamps modificados talvez com base no seu exemplo. Verifique esses antes de executar o rsync pela segunda vez. Quando o rysnc vê carimbos de data e hora diferentes, ele faz uma "transferência" desse arquivo, mesmo se nenhum dado do arquivo estiver envolvido, e apenas metadados.