Bem, você pode executá-lo em Wine , que é uma camada que permite que você execute aplicativos do Windows no Ubuntu.
A outra opção é usar o plug-in do protocolo Pidgin para se conectar ao MS Office Communicator. é oferecido sob o nome pidgin-sipe. Para instalar e obter mais informações, consulte o site do Projeto SIPE.
Ou para instalar basta clicar Pidgin-Sipe