Depende de quanto você confia em seus usuários e que tipo de compartilhamento de arquivos você está fazendo. Você não quer o compartilhamento de arquivos "wild west" em seus CDs, então eu trancaria essa parte com os permanentes / GPOs do NTFS e verifique se você sabe o que está acontecendo lá.
Mas, dito isso, a Microsoft cria o SBS para ser um servidor tudo-em-um, então, por implicação, eles estão dizendo que está tudo bem em usar um servidor para AD e compartilhamento de arquivos ao mesmo tempo lugar.
Eu também colocaria os compartilhamentos de arquivos e informações do AD / OS (como sysvol) em diferentes partições uns dos outros.
Dado o número de usuários que você tem e assumindo que seu comportamento de usuário e o tipo de arquivos que você colocaria nos DCs são bem padronizados, eu acho que você está bem, especialmente se você estiver tentando pinçar tostões.