Você quer algo como DRDB ou rsync em um cron freqüente. Eu escolheria o DRDB, pessoalmente.
O mklivecd certamente não é a ferramenta certa para esse trabalho, nem tente ajustá-lo.
Edit: Acabei de ver que você atualizou dizendo que este é um banco de dados e servidor web. Você vai querer usar o mecanismo de replicação do DBMS para isso e usar o DRDB para o conteúdo da web. Você não deve usar o DRDB para bancos de dados ao vivo.