Há uma pequena caixa de seleção na parte inferior da janela que diz "Ocultar todos os serviços da Microsoft". Antes de desabilitar os serviços aleatoriamente, marque esta caixa para que você desabilite apenas as coisas novas que foram adicionadas ao longo do tempo.
Dois outros ótimos recursos para solucionar problemas de tempos de inicialização lentos são:
Autoruns ( link ) que mostrará tudo o que é executado na inicialização (há muitos lugares diferentes além do que o MSConfig mostra)
e
Process Monitor ( link ) que permitirá que você ative o log de tempo de inicialização. Você pode ligar o log, reiniciar o computador, parar o log e analisar o log após a reinicialização para ver exatamente o que está ocupando o tempo de inicialização (você pode achar que é apenas um driver desatualizado em algum lugar que só precisa ser atualizado).