Acontece que eu tive um programa conflitante: inputlirc
Depois de removê-lo, reconfigurar o lirc, reinicializar, reconfigurar as teclas do teclado, tudo parecia estar funcionando.
$ sudo apt-get purge inputlirc
$ sudo dpkg-reconfigure lirc
$ sudo reboot now
$ sudo ir-keytables -c -w /etc/rc_keymaps/rc6_mce
irw
não apresenta problemas.
$ sudo irw
000000008001006c 00 KEY_DOWN devinput
000000008001001c 00 KEY_ENTER devinput
000000008001006f 00 KEY_DELETE devinput
Para tornar o efeito permanente, tenho que editar /etc/rc.local
/etc/init.d/lirc stop
/usr/bin/ir-keytable -c
/usr/bin/ir-keytable -w /etc/rc_keymaps/rc6_mce
/etc/init.d/lirc start