Você deve exibir o (s) certificado (s) intermediário (s) na cadeia de certificados.
Isso é o que o teste que você vinculou diz: "O certificado não é confiável em todos os navegadores da Web. Talvez seja necessário instalar um certificado Intermediário / de cadeia para vinculá-lo a um certificado raiz confiável."
Ou seja, o cliente só deve ter o certificado raiz em sua loja de certificados confiáveis, você deve atender todo o resto da cadeia.
Veja, por exemplo, o relatório do SSLLabs , onde mostra:
Chain issues: Incomplete, Extra certs
E na cadeia que construiu, mostra:
2 Extra download Let's Encrypt Authority X3
Fingerprint SHA256: 25847d668eb4f04fdd40b12b6b0740c567da7d024308eb6c2c96fe41d9de218d
Pin SHA256: YLh1dUR9y6Kja30RrAn7JKnbQG/uEtLMkBgFF2Fuihg=
RSA 2048 bits (e 65537) / SHA256withRSA
("Download extra" é a chave).
Sirva tanto o seu próprio certificado como este certificado intermediário e os clientes com uma loja confiável moderna ficarão felizes, com apenas o seu próprio certificado que é mais um coin flip.