Você pode adicionar seu usuário administrador a administradores locais com um script de inicialização de net localgroup administrators domain\adminuser /add
.
Eu não acho que seja necessário, no entanto. Eu acho que seu script em lote seria executado muito bem como um script de inicialização para computadores. Ele seria executado como a conta do computador, portanto, as contas de computador precisariam acessar o compartilhamento.