Isso deve funcionar:
[mysqld]
character-set-server=utf8mb4
collation-server=utf8mb4_unicode_ci
init-connect='SET NAMES utf8mb4'
Pode ser que você precise definir essas opções também:
[client]
default-character-set=utf8mb4
[mysql]
default-character-set=utf8mb4
Espero que ajude. Felicidades
Atualização: alterada para utf8mb4