/ var é simplesmente o padrão e a maioria das pessoas mantém o padrão em tudo o que fazem. Se for um site simples, há poucas razões para alterá-lo. Eu gerencio uma aplicação web muito complexa e achei útil movê-la para / srv para que ela fique isolada de outras coisas. Isso é muito mais para minha conveniência e para me proteger do meu próprio descuido do que qualquer coisa.
Mas, tecnicamente falando, não importa onde você o coloca.