Você pode usar rpm -qa
e / ou yum list installed
para obter uma lista dos pacotes instalados.
rpm -qa httpd
ou
yum list installed httpd
Se o pacote httpd relevante não estiver instalado, o httpd foi definitivamente compilado.
O texto acima determinaria se um pacote relevante havia sido instalado, mas não ajudaria se um binário tivesse sido posteriormente compilado e usado para substituir o original.
Você pode verificar os arquivos de uma rpm
rpm -V httpd
isso diria se os arquivos no pacote httpd foram alterados desde a instalação.