Que tipo de FS é esse? No caso de ext2 / 3/4, se você criou o FS sem especificar blocos reservados, existem 5% de blocos reservados por padrão, ou seja, 50 GB no caso de um sistema de arquivos de 1 TB.
tente seguir:
tune2fs -l /dev/blah |grep -i reserved
Estes são blocos reservados para o usuário root - isto faz sentido para sistemas de arquivos essenciais para rodar o SO, ie rootfs, / var, / tmp etc. mas é seriamente contraproducente para / home, / apps etc ...
Se você quiser remover a reserva, digite o seguinte:
tune2fs -m0 /dev/blah