Desculpe quebrar isso com você, mas você está fazendo isso do ângulo errado. :)
Em vez de modificar diretamente a configuração do seu servidor e depois ter que se preocupar em fazer o backup, você deve estar usando um sistema de gerenciamento de configuração.
Eu sou parcial ao Ansible, mas existem muitas outras opções muito viáveis.
Uma vez que você tenha um sistema de gerenciamento de configuração configurado, suas configurações não só serão salvas em backup, mas também poderão ser controladas por versão e facilmente posicionadas em uma hierarquia de desenvolvimento / preparação / produção. Além disso, se seu servidor morrer, você poderá implantar e configurar um novo automaticamente, normalmente em poucos minutos, em vez de instalar e configurar as coisas manualmente, o que é propenso a erros, tedioso e demorado.