Eu consertei isso no branch master github.com/s3tools/s3cmd. Ele foi introduzido no novo código da assinatura v4, mas não precisa ser um aviso (), mas sim diminuído para info (), que não será reproduzido em execuções normais.
Ao executar s3cmd, recebo um aviso de redirecionamento da seguinte forma:
WARNING: Redirected to: xyz.s3-eu-west-1.amazonaws.com
O script que produz o aviso é este:
s3cmd sync /var/backups/db/ s3://xyz/database/
Eu usei esse script antes em outro lugar sem essa mensagem de aviso. É um problema porque eu o uso como um script de execução post automysqlbackup e o aviso aciona uma notificação por e-mail de erro.