Você pode ter hosts com diferentes versões do ESXi gerenciadas pelo mesmo servidor vCenter. Até a semana passada, tivemos alguns hosts ESXi 5.0.0 gerenciados pelo nosso servidor 5.5.0u1 vCenter, que também gerencia todos os nossos hosts 5.5.0u1.
Quando notei a diferença de versão, atualizei os hosts o mais rápido possível, mas estivemos nesse estado, com a maioria de nossos hosts (e o servidor vCenter) em 5.5.0u1 e alguns hosts em 5.0.0, para pelo menos vários meses.
De fato, ter versões diferentes do ESX / ESXi no mesmo cluster é até mesmo suportado - veja esta postagem no blog da VMware para detalhes sobre isso , incluindo o que não fazer. Deve servir como confirmação oficial de que você pode ter diferentes versões do ESXi no mesmo vCenter, mesmo que você não esteja planejando misturar versões do ESXi em seu cluster.