Geralmente, tarefas agendadas que fazem coisas como "arquivos de backup" e "enviar e-mail" precisam fazer isso no contexto do usuário cujos arquivos estão sendo manipulados. Isso garante que eles tenham permissão para ler e gravar os arquivos e que as ações executadas possam ser auditadas como correspondentes a esse usuário.
Então, você desejará executar os trabalhos cron como o usuário em cujo nome eles agem.