Você terá arquivos de dados separados (incluindo o banco de dados MySQL) para cada instância.
Ao criar instâncias adicionais, você precisa atribuir a eles seu próprio diretório de dados e copiar os arquivos de dados da instância original ou, preferencialmente, usar mysql_install_db
para inicializar os arquivos necessários.
Uma lista rápida e suja de etapas pode ser encontrada aqui , embora o autor não discuta realmente a criação dos scripts start / stop em /etc/init.d, que são discutidas aqui .