Para responder à sua pergunta diretamente, o que melhor pode melhorar a tolerância do seu sistema à falha do disco rígido é usar seus discos rígidos extras em peças de reposição. Com uma contagem de discos tão baixa, as chances de ter duas falhas simultâneas de unidade são baixas o suficiente para que você possa confiar no backup. Ter um hot spare, no entanto, permitirá que o sistema se recupere muito mais rapidamente (e com segurança) de uma única falha na unidade. Você precisará de duas peças de reposição: uma de cada tamanho.
Eu tenho que adicionar, no entanto, que parece que você está indo na direção errada aqui. Primeiro, você precisa entender que o RAID não é um sistema de backup. Há muitas coisas que podem dar errado com seu RAID, que causam perda total de dados: erro de manipulação, falha do controlador, vírus, fogo / água no próprio servidor. Você precisa usar um sistema de backup real.
Em segundo lugar, a melhor maneira de aumentar a redundância de um AD não é melhorar o subsistema de disco ou ter um backup melhor, mas adicionar um segundo controlador de domínio, se possível em um local físico diferente. Isso aumentará o tempo de atividade muito mais do que qualquer coisa que você fará para uma configuração de servidor único.