É possível que seus drivers de GPU estejam interferindo; ou que o seu hw não é compatível com 3d. Por favor, publique o resultado do seguinte comando:
'$ /usr/lib/nux/unity_support_test -p'
Se você estiver usando drivers da nVidia: Execute o seguinte comando para removê-los e reinicialize:
'$sudo apt-get purge nvidia-current
'$sudo apt-get remove nvidia-current-updates
'sudo apt-get remove nvidia-experimental-304)
Ou apenas abra o Synaptic e procure por nvidia, exclua tudo o que você vê agora.
Reinicie o sistema. Veja se tudo está funcionando. Execute este comando para verificar se o Unity-3D funcionará:
$ /usr/lib/nux/unity_support_test -p
Reinicie novamente. Reinstale os drivers mais recentes da nVidia:
$sudo apt-get install nvidia-current-updates
Se estiver usando drivers de GPU AMD / ATI: Execute o seguinte comando para removê-los e reinicialize:
'$sudo apt-get purge fglrx'
Não os reinstale, pois as placas ATI não suportam atualmente o Unity-3D.