O problema é como você combina a conta de um lado com a conta do outro. Isso fará o extrato.
Alguma idéia de como fazer a correspondência na importação? Você tem um campo comum como employeeID em ambos? Caso contrário, pode ser necessária uma correspondência de vários campos complicada.
get-aduser -filter * -searchbase "ou=users,dc=adomain,dc=com" -properties Telephonenumber|select displayname, givenname, sn, telephonenumber|export-csv phones.csv
import-csv phones.csv| foreach {
get-aduser -displayname $_.displayname -searchbase "ou=contacts dc=Bdomain,dc=com" | set-aduser -telephoneNumber $_.telephonenumber
}