As descrições que você vê no centro de software não são do arquivo setup.py (ou de outros arquivos semelhantes) para o aplicativo. Esses são definidos na própria embalagem, que está no servidor.
No arquivo debian / control, você precisa separar cada parágrafo com uma linha que contém apenas um ponto no início, e cada linha, exceto o resumo inicial de uma linha, deve ter um único espaço no começo.
Você deve usar a formatação padrão de string de várias linhas do Python para a long_description em setup.py, e deve simplesmente ter uma linha em branco entre os parágrafos lá. Se você estiver usando vários literais de string, em vez dos literais de aspas triplas, deverá ter uma string vazia para as linhas em branco separar os parágrafos.