Eu realmente recomendo que você considere limpar a caixa e reinstalá-la novamente com o CentOS 5. As instalações do CentOS para a versão principal são muito difíceis.
Além disso, se esta máquina estiver rodando há alguns anos, acumulará muita coisa que você pode se livrar. Faça um bom backup e reinstale. Se este for um servidor de produção, tente construir uma máquina duplicada, validando-a e, em seguida, alternando.
Este é um ótimo momento para configurar um sistema de gerenciamento de configuração como cfengine ou fantoche para mover o estado do sistema para fora da máquina e facilitar esse tipo de atualização no futuro.