Para apagar um arquivo em sistemas do tipo Unix, você precisa de permissão de escrita no diretório que o contém, não no próprio arquivo. Isso ocorre porque a operação subjacente está realmente modificando o diretório, removendo (desvinculando) uma entrada dele.
Para fazer o que você deseja fazer, o diretório que contém o arquivo que você deseja excluir deve ser gravável por www-data
.