Já se passaram dois anos desde que eu usei o Quickbooks, mas o produto muda muuuito devagar que minha experiência provavelmente é relevante.
O QB on-line custa US $ 35 por mês ou US $ 420 por ano, o que é muito caro comparado a apenas comprar o software. Além disso, a versão online tinha menos recursos do que a versão empacotada, mas você terá que determinar se esses recursos são importantes para você. Como eu disse antes, o QB muda muito lentamente, então quase não há necessidade de atualizar para uma versão mais recente até que sua versão atual se torne obsoleta, o que geralmente leva de 3 a 4 anos. Portanto, se você comparar o QB on-line a um pacote (suponha que seja o Premier), estará pagando US $ 1700 por 4 anos, contra US $ 400,00.
Acho que a versão on-line NÃO é um bom valor.
Uma outra consideração, se você precisar desligar sua empresa, pode simplesmente colocar seus softwares e bancos de dados de lado, se necessário, para uma auditoria, mas a versão online precisa ser paga ou vai embora. Intuit pode ter alguma maneira de lidar com isso, mas eu ficaria desconfiado.