Acredito que os 98% que você está vendo referem-se ao número total de atualizações instaladas em relação ao número total de atualizações aplicáveis a essa máquina. Não representa o quanto de uma única atualização foi instalada. O triângulo amarelo ao lado do nome do sistema indica que atualizações adicionais precisam ser aprovadas para a máquina.
Para ter uma idéia melhor do que é necessário para essa máquina, adicione as colunas "Instalado", "Falhou" e "Necessário" ao seu monitor clicando com o botão direito em qualquer uma das colunas (por exemplo, Nome, Endereço IP, Operando Sistema).
Você também pode clicar duas vezes no nome da máquina para gerar um relatório que informará o que ainda é necessário.