Esta é uma limitação de código - manipular chaves modificadoras apenas é diferente de manipular uma combinação de teclas incluindo modificadores, e eu não acho que alguém iria querer usar apenas Super como a tecla de convocação.
Você também tem problemas estranhos como Unity (e GNOME Shell), onde somente Unity obtém pressionamentos de teclas que contêm Super .
Seria possível implementar atalhos de teclado apenas modificadores, mas não tenho certeza de quanto esforço seria necessário. Eu aceitaria uma solicitação de mesclagem ou patch limpa implementando isso, mas não estou planejando implementar isso em um futuro próximo.