Você pode estar tendo problemas com o gerenciamento de energia do seu disco rígido. Eu tive MUITOS problemas com suspensão / retomada do Ubuntu, e também tentei todas as coisas que você mencionou. Outra coisa que tentei foi reconfigurar o gerenciamento de energia do disco rígido.
Você pode tentar editar "/etc/laptop-mode/laptop-mode.conf" a partir disso:
# Power management for HD (hdparm -B values)
#
BATT_HD_POWERMGMT=1
Para isso:
# Power management for HD (hdparm -B values)
#
#BATT_HD_POWERMGMT=1
BATT_HD_POWERMGMT=254
LM_AC_HD_POWERMGMT=254
NOLM_AC_HD_POWERMGMT=254
Pode ajudar. Boa sorte!