Não, com uma ressalva. Se você alterou alguma coisa para ESTABLISHED
pacotes, suas conexões existentes poderão se comportar de maneira diferente. Mas é improvável que você fez. Basta ver se você ainda pode se conectar a ele.
Um pequeno plano de fundo: os pacotes de rede sempre passam pelas cadeias que você vê quando executa iptables -L
; serviço não tem que se registrar no firewall, ou algo parecido.