Como os discos físicos parecem estar corretos (a matriz RAID é normal), provavelmente é o problema com o próprio controlador.
1) Eu recomendaria verificar se há um firmware atualizado para o controlador que pode corrigir esses problemas.
2) Para solucionar ainda mais, considere desabilitar o armazenamento em cache do RAID (desligue sempre Read-Ahead e mude para Write-Through). Se houver algum outro mecanismo de cache presente nas configurações da matriz RAID, considere a possibilidade de desativá-los também. Essas medidas não afetarão seus dados (às vezes podem ser feitas até mesmo em tempo real) e podem corrigir o problema. Esta é uma correção temporária e, se ajudar, você provavelmente precisará substituir o controlador.