Se você quiser, pode usar o Active Directory para basicamente qualquer coisa que possa usar um banco de dados.
Para essa questão, uma vez trabalhei em uma empresa cujo produto armazenava milhões de dispositivos de rede de clientes e suas configurações no Active Directory. Para o registro, esta é uma ideia estúpida, mas mostra o que é possível com criatividade suficiente ... e decisões de design questionáveis.
Então, com certeza, você poderia usar o Active Directory como um diretório de clientes. A questão mais importante é por que você gostaria e por que você não usaria um produto diferente que fosse mais adequado para (e até mesmo projetado especificamente para) o rastreamento das informações do cliente.