Para a pergunta original: Sim, 1x / 24 IPv4 e 1x / 64 IPv6 para cada VLAN estão bem. Você estará criando uma configuração típica de pilha dupla . Se você definir o IPv6 como preferencial em /etc/gai.conf , seus computadores usarão o IPv6 onde estiverem disponíveis (em toda a sua intranet e na Internet, quando disponível) e retornarão ao IPv4 NAT para hosts / serviços que ainda não estão habilitados para IPv6 (a maior parte da Internet no momento, infelizmente, embora, se os usuários gastarem a maior parte do tempo no youtube e no facebook, talvez não percebam :).
Uma vez que você não precisa mais se conectar a nenhum site / serviço IPv4, você pode desativar o IPv4 e o NAT (ainda que não seja por algum tempo - se você planeja permitir o acesso geral à Internet).
Para uma pergunta atualizada: Não há necessidade de incomodar seu provedor com seus / 64s. Eles lhe deram / 48, e terão todo o prazer de encaminhar todas as suas redes incluídas nesse intervalo (até 65536, se forem de tamanho / 64!), Sem que você precise perguntar nada a elas. Tudo o que você precisa é uma rota padrão para eles e rotas / 64 específicas para cada uma das suas VLANs no seu roteador.