Resolução de nomes apenas um problema possível. Você não pode juntar as duas máquinas ao mesmo domínio. Um ou outro terá uma relação de confiança de domínio interrompida como resultado da adesão ao outro.
Sua única opção seria obter uma cópia do Active Directory (AD) virtualizada em seu ambiente UAT e testando com ela. Este é provavelmente um pedido não-trivial para o seu departamento de TI (e eles provavelmente vão olhar para você engraçado se você pedir), mas é viável.
Quando tive migrações críticas de produção que precisam ser testadas, concluídas com o AD, fiz esse tipo de coisa. É preciso fazer alterações temporariamente no domínio de produção (para adicionar o CD virtual, permitir que ele seja replicado e executar uma limpeza de metadados depois de removê-lo "com força" do domínio), e muitos administradores não ficarão bem com isso.
Editar:
Se os dois conjuntos de máquinas não precisarem ser associados ao domínio ao mesmo tempo, você estará bem. A resolução de nomes de NetBIOS seria problemática se eles estivessem na mesma sub-rede IP, portanto, verifique se eles estão em sub-redes diferentes e isso não será um problema.
No que diz respeito à cópia de arquivos entre as máquinas, desde que você tenha uma comunicação TCP arbitrária entre as máquinas, você sempre poderá usar os endereços IP nos UNCs para acessar os outros conjuntos de máquinas, mesmo que tenham nomes conflitantes.