Pode ser devido a algumas propriedades físicas do disco rígido. Por exemplo, se o layout do disco rígido for assim:
/dev/sda1 -> NTFS
/dev/sda2 -> ext3/4
/dev/sda3 -> swap
e sua partição ext3 / 4 está vazia e a partição swap está sendo usada, então a cabeça do disco rígido precisaria pular entre dois locais físicos no disco.
Além disso, os fragmentos de NTFS, o que significa que quando você escreve arquivos, ele escolhe a primeira área vazia e quando ela é preenchida, ela irá para a próxima área vazia (ou buraco) no disco. Isso significa que a cabeça do disco rígido só se move em uma direção; uma vez que a área vazia é preenchida, passa para a próxima, mas não volta.
partições ext3 / 4 não se fragmentam [muito]. Quando você escreve um arquivo em uma partição ext3 / 4, ele tentará encontrar uma área onde o arquivo possa caber em uma área vazia contínua. Isso significa que ele terá que verificar o disco em busca de áreas vazias antes de gravá-lo.
Por favor, note que eu não pesquisei o que eu disse acima, então tudo pode estar errado:)
Ah, sim, se mais alto, você quer dizer que o motor gira mais rápido, e não o som do clique, provavelmente porque a partição do Ubuntu está localizada mais próxima do centro do disco do que a partição do Windows. O disco precisa girar mais rápido para ler / gravar a mesma quantidade de dados em um determinado período de tempo em direção ao centro do que ao exterior.