Deve estar em .config / htop / htoprc ou algo semelhante.
Eu diria que você tem essa linha no seu arquivo de configuração
shadow_other_users=1
Você deve colocá-lo em 0. Caso contrário, se você iniciar o htop com seu usuário, ele ocultará os processos de outros usuários. Você pode por favor postar seu arquivo htoprc se isso não funcionar?