Em 2008 R2, você normalmente não terá um C: \ Boot ou um C: \ Bootmgr. Você pode verificar a localização do gerenciador de inicialização e do Windows Loader executando o BCDedit sem opções de um prompt de comando elevado. Em uma instalação limpa do 2008 R2 MBR, recebo:
Windows Boot Manager
--------------------
identifier {bootmgr}
device partition=\Device\HarddiskVolume1
description Windows Boot Manager
locale en-US
inherit {globalsettings}
default {current}
resumeobject {0a38afb2-2263-11e3-9f8e-c1b384c483b5}
displayorder {current}
toolsdisplayorder {memdiag}
timeout 30
Windows Boot Loader
-------------------
identifier {current}
device partition=C:
path \Windows\system32\winload.exe
description Windows Server 2008 R2
locale en-US
inherit {bootloadersettings}
recoverysequence {0a38afb4-2263-11e3-9f8e-c1b384c483b5}
recoveryenabled Yes
osdevice partition=C:
systemroot \Windows
resumeobject {0a38afb2-2263-11e3-9f8e-c1b384c483b5}
nx OptOut
A localização do Bootmgr Device \ HarddiskVolume1 corresponde à partição 100mb 'System Reserved' criada na instalação.