Não. O planejador de consulta MySQL não suporta multi-CPUs.
Veja também:
Estou executando uma consulta MySQL muito intensiva e notei que apenas um núcleo está sendo usado para 100% enquanto os outros núcleos estão ociosos. O sistema está executando o Ubuntu 12.04 e o MySQL 5.5.28
Existe uma maneira de forçar o MySQL a usar todos os núcleos?